小智（松本梨花 配音）带着皮卡丘（大谷育江 配音），和同伴们继续前行在冒险的旅途之中。路上，一行人遇见了带着神奇宝贝胡巴（钉宫理惠 配音）的少女麦亚丽（中川翔子 配音）。胡巴能够制造出神奇的时空圆环，带领大家在不同的地点来回穿梭。 地处沙漠腹地的城市迪赛鲁西坦到了，曾经，在这里发生过一场声势浩大的神奇宝贝战争，亦是因为这场战争，这里才成为了干涸少水的沙漠。在这里，麦亚丽和哥哥巴尔扎（藤原龙也 配音）汇合了，让大家没有想到的是，巴尔扎竟然得到了封印着可怕神奇怪手的瓶子。在误打误撞之中，封印被解开了，那个曾经终结过迪赛鲁西坦的可怕怪兽重见天日，而它的真实身份，竟然是超胡巴（山寺宏一 配音）。
卡罗琳·劳伦斯 汤姆·肯尼 劳伦斯先生 玛丽·乔·卡特利特 克兰西·布朗 比尔·法格巴克 罗德格尔·邦帕斯 迪·布拉雷·贝克尔 Christopher Hagen 瑞欧·亚历山大 Ryan Begay 伊利娅·伊索雷利·保利诺 马修·卡德瑞普 旺达·塞克丝 吉尔·塔利 克雷格·罗宾森 格蕾·德丽斯勒 约翰尼·诺克斯维尔 凯瑞·华格伦 Miles Hall
劳伦斯先生 克兰西·布朗 汤姆·肯尼 迪·布拉雷·贝克尔 比尔·法格巴克 罗里·艾伦 玛丽·乔·卡特利特 凯特·希金斯 罗德格尔·邦帕斯 卡罗琳·劳伦斯 吉尔·塔利 Austin Valli Natalie Kailey Toby Larsen 大卫·尼德姆 Sale Taylor 丽莎·林德 Abbi Ella Gonzales Genesis Clarre